APT-GET PHP deaktivieren

Naja daraus lernst du, dass du niemals Addons mit selbst heruntergeladenen Paketen mischen solltest. Zumindest nicht solange du das Paketsystem von Debian und den Aufbau der readynasxtras Addons nicht verstanden hast.
Die Paketquellen im ReadyNAS sind uralt, die Addons werden dagegen aus den Quellen stets sehr aktuell zusammengebaut inkl. aller neuen Abhängigkeiten.

Du hast zwar mit deinem ursprünglichen apt-get install befehl nur das php Modul installieren wollen, aber APT löst gleich alle Abhängigkeiten mit auf und installiert auch alle benötigten Voraussetzungen.
Und diese Voraussetzungen sind immer genau auf eine Version abgestimmt. Mit dem Addon hast du auch alle Abhängigkeiten gleich mal um ein paar Versionen geupdated und die sind nicht kompatibel mit den Paketen aus den APT Quellen.

Lange rede kurzer Sinn:
Du musst die Sachen in der umgekehrten Reihenfolge deinstallieren in der du Sie installiert hast.
Zuerst das Addon entfernen. Danach sollte auch die PHP Version vom APT-Get nicht mehr da sein. Im Zweifel kannst du nach dem Addon deinstallieren einfach mal

apt-get autoremove 
apt-get remove libapache2-mod-php5 php5-common

raushauen.
DANACH kannst du dann nochmal versuchen das Addon wieder zu installieren.
Wenn dieser Reparaturvorschlag scheitert, hast du noch 2 Optionen:
Weiter manuell die Abhängigkeiten auflösen und rückabwickeln oder die Firmware neu installieren (bin mir nicht sicher ob das hier ausreicht oder ob ein kompletter Factory Reset von nöten ist).