ホットスワップをしようとHDDを入れ替えても何も起きない

HGST Deskstar NAS HDN724040ALE640は4TBだと思いますが、それでも入れ替え前後で1台あたりの容量が変わらないのでその点については問題ないと思います。

ただし、OSでWD40EFRX-RT2を認識できていないどころかHGST Deskstar NAS HDN724040ALE640が4台のままと誤認しているようですので、一旦電源を切ってからHDDを交換し電源を再投入してみて下さい。

それでもHDDを正常に認識しないようであればNASのハードウエアトラブルかもしれません。

ちなみにOSは6.2.0ということで宜しいですか？

また最後になりますが、交換しようとしているHDDは新品購入時のままで、他のシステムでフォーマットがされていないということで宜しいでしょうか。

他のシステムで使用していた（フォーマットされた）HDDを使用する場合はホットスワップできませんので、適宜OSのバージョンに合ったマニュアルを参照してください。